774.敌人的敌人就是朋友 (3-2)

我们使用数据估计了每个肿瘤样本的癌细胞比例，并使用转录组去卷积方法uer估计和比较了790和790肿瘤中癌症和间质细胞中的基因表达。值得注意的是，我们推测在790肿瘤的癌细胞中，肺腺癌标志基因如、21、2和3的表达普遍且几乎完全丧失。此外，我们观察到鳞状细胞癌或神经内分泌癌的组织学标志基因在一小部分790肿瘤中的表达增加的表达降低。值得注意的是，对三个未接受治疗的腺癌队列的分析表明，低腺癌标志物基因的表达非常罕见，仅在野生型肿瘤中观察到。总而言之，这些数据突显了耐药后获得性谱系可塑性以前被低估的程度，特别是在790肿瘤中，与3扩增和非衰老突变签名过程共存，潜在地促进了表皮生长因子受体独立的信号机制。

鉴于检查点抑制剂在突变的中缺乏疗效，我们试图描述与耐药相关的免疫环境，最初根据“细胞炎症基因表达谱”特征对肿瘤进行分层。

然后，我们使用了一种已发表的计算方法进一步阐明与耐药相关的浸润免疫细胞亚群。这表明，与免疫790肿瘤相比，免疫790中s的推测水平更高，而2的水平更低。免疫790中1、3和的表达也显著高于免疫790肿瘤。接下来，我们调查了耐药时的免疫表型是否与之前12的持续时间有关。有趣的是，免疫790肿瘤的总最短，其中一半的总小于3个月。相反，免疫790肿瘤的总生存期最长，与免疫冷藏790肿瘤相比。et分析强调单剂免疫检查点抑制剂在突变的非小细胞肺癌、78患者中缺乏疗效，这与et分析一致。然而，一名免疫790患者在临床试验中接受了nivlubipiliub免疫检查点抑制剂的联合治疗，并获得了89个月的稳定病情。综上所述，我们的数据提示炎性趋化因子的潜在作用，例如，9可能由s驱动在介导790耐药中发挥作用。此外，我们的数据突出了“热”肿瘤中成分的显著异质性，说明需要更详细地询问免疫环境以描绘特定的免疫靶点。

虽然第三代s越来越多地被采用在一线环境中，但这种临床实践在一定程度上是由于无法预测单个患者的耐药轨迹。在确定了与不同抵抗状态相关的新的分子特征后，我们试图建立一个模型来预测790的出现。我们推测，这些基因组、染色体水平和转录特征可能存在于基线水平，也可能代表在治疗过程中获得的变化。为了进一步探讨这一点，我们确定了在12治疗开始之前可能存在的三个躯干特征：外显子19缺失、缺失和53改变。使用贝叶斯方法，单个患者可以根据他们治疗前的分子基因型被分成不同的组，其发生790耐药的几率非常不同。例如，在非肿瘤中，发生790耐药性的概率在872到979之间，这可能意味着序贯治疗第一代第二代到第三代可能是这些患者可行的临床策略。这些特征的预测能力需要在更大的队列中进一步验证。然而，这些结果说明了数据驱动的治疗算法是如何通过真实世界的证据得出的，并可能有助于为个别患者定义最佳的排序策略。

我们的研究首次对耐药的基因组和转录图谱进行了全面和综合的分析。值得注意的是，我们的数据显示，到目前为止，血统的可塑性在一定程度上被低估了。尽管在耐药后有1到3的患者有组织转化的报道，但我们发现在790肿瘤中，腺癌标志物普遍丢失，同时非tru亚型明显富集。虽然缺乏配对的基线样本是我们研究的局限性，但与治疗单纯的突变的非小细胞肺癌的比较表明，腺癌谱系标志的丢失，特别是在790疾病中，可能代表了慢性暴露导致的早期去分化事件。790疾病更显著的基因组改变有53突变、3扩增和改变，这进一步导致了790的可塑性和耐药性。

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